Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTLNQ9NXG0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms