Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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