Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SERINC1Q9NRX5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SERINC1Q9NRX5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms