Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARD6AQ9NPB6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms