Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPJQ9HC77 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPJQ9HC77 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPJQ9HC77 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPJQ9HC77 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPJQ9HC77 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPJQ9HC77 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPJQ9HC77 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms