Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms