Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms