Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP44Q9C0F1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms