Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCGF6Q9BYE7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCGF6Q9BYE7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms