Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIMM29Q9BSF4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIMM29Q9BSF4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms