Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
RETNLBQ9BQ08 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms