Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3CQ99985 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 313 ms