Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PITX2Q99697 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms