Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
JSRP1Q96MG2 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms