Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms