Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms