Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNFT2Q96EX2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms