Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFHD2Q96C19 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms