Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMIGD2Q96BF3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMIGD2Q96BF3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TMIGD2Q96BF3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIGD2Q96BF3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIGD2Q96BF3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIGD2Q96BF3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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