Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms