Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCTD13Q8WZ19 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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