Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PYDC1Q8WXC3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms