Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC12Q8WUD4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms