Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms