Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HECW1Q76N89 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms