Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDZD4Q76G19 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms