Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms