Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRNP1Q6NT89 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRNP1Q6NT89 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms