Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms