Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FNDC7Q5VTL7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FNDC7Q5VTL7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms