Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP170Q5SW79 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms