Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR44Q5JSH3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms