Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GREB1Q4ZG55 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms