Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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