Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ8

DEFB112, Beta-defensin 112, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB112Q30KQ8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DEFB112Q30KQ8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms