Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms