Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PDK4Q16654 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK4Q16654 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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