Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CTF1Q16619 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTF1Q16619 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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