Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCBQ16585 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms