Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GRIK4Q16099 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms