Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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ZNF56Q15929 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ZNF56Q15929 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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