Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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ZIC1Q15915 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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