Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SURF2Q15527 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms