Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC23BQ15437 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms