Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE3CQ15386 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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