Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTPRKQ15262 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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