Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms