Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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