Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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