Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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